2月13日晚，日本厚生劳动省公布，日本境内新冠肺炎患者达到了251人，其中1人死亡，3人感染途径不明，均无海外旅行史，无密切接触史，而且相隔甚远，分别是和歌山县、神奈川县、千叶县、东京都。

鉴于新冠肺炎的感染不断扩大，日本政府出台紧急应对措施，拿出103亿日元的专项经费，用以支持研制简易检测试剂盒、研发疫苗，推进口罩增产，负担湖北归国日侨的检查费、治疗费等。日本政府还要求各都道府县都设置门诊，接收疑似被感染人员，政府将提供必要的财政支援。

与此同时，日本政策金融公库也将拿出5000亿日元的专项资金，为由于中国游客减少而导致业绩恶化的中小企业，提供紧急贷款和担保。无法从中国采购零部件的设备生产企业，也将得到政府补贴。

有其他国家的报告显示，抗艾滋病药物对新冠肺炎有一定治疗效果，日本政府也将投入3亿日元用来确认其效果及安全性。